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目的 了解甘肃省发热呼吸道症候群(febrile respiratory syndrome,FRS)病原学监测情况,评价监测结果,为提升其监测能力提供参考依据.方法 收集2009-2019年甘肃省17所哨点医院FRS监测病例,采用观察性研究,分析病原监测状况并评价其监测结果.结果 甘肃省2009-2019年FRS病原总检测率为89.00％,总检出率为31.43％.所有病原(病毒/细菌)的检出能力高于任一病原(病毒/细菌)(P＜0.001),其中任一病毒检测率及检出率均高于任一细菌(P＜0.05),所有病毒检测率高于所有细菌(x2=2 876.656,P＜0.001),检出率低于所有细菌(x2=84.237,P＜0.001);病原检测种类方面,病毒以人流感病毒检测率最高(99.93％)、鼻病毒检测率最低(53.77％),细菌以同时检测肺炎支原体与肺炎衣原体居多,检出率较低(4.15％);临床症状以发热、咳嗽、咳痰为主,病原检测阴性者容易出现发热、胸痛、乏力和呼吸困难症状.监测结果评价显示病例类型的均衡性、采样时间的连续性有待提高.结论 甘肃省FRS病原检测水平较高,建议通过合理调整病原检测种类、采集匹配的标本类型和重复检测阴性病例等措施提高病原检出能力,完善监测平台,提高监测能力.