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充分发挥高校的主体性作用，以自我评估为主线，科学理性地选择多元评价方式，构建适应新形势新要求和本校办学特色的学科自我评估机制，是高校学科发展战略面临的新课题。在分析军队院校学科自我评估存在问题的基础上，结合军队院校学科建设的特点，阐述军队院校学科自我评估的基本原则，并从组织机构、指标体系、专家队伍、组织形式、实施程序、信息平台等方面探讨军队院校学科自我评估机制的构建问题。