猪miR-149靶基因预测及生物信息学分析

来源 :河南农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wubin811030

【摘要】

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通过对猪miR-149进行靶基因预测及相关生物信息学分析,探索其影响猪颗粒细胞凋亡和卵泡闭锁的作用机制。首先利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测ssc-miR-149在氧化应激组和正

【作者】

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张家庆武松霞任巧玲王献伟陈俊峰王璟白

【机构】

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河南省农业科学院畜牧兽医研究所,河南省标准化研究院,河南省畜牧总站

【出处】

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河南农业科学

【发表日期】

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2019年3期

【关键词】

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ssc-miR-149 靶基因生物信息学颗粒细胞凋亡卵泡闭锁

【基金项目】

：

河南省自然科学基金项目(162300410161);河南省农业科学院自主创新基金项目(2018ZC53);河南省重点研发与推广专项(182102110063)

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通过对猪miR-149进行靶基因预测及相关生物信息学分析,探索其影响猪颗粒细胞凋亡和卵泡闭锁的作用机制。首先利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测ssc-miR-149在氧化应激组和正常组表达量的变化,通过转染miR-149mimic并利用MTT和qRT-PCR检测细胞活性和凋亡基因的表达情况,同时预测ssc-miR-149与细胞凋亡相关基因的靶向关系;然后利用JASPAR、PROMO、TargetScan、miRanda、RNAhybrid、DAVID等软件和NCBI、miRBase、Ensemb

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