【摘 要】
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目的研究2010年与2011年广州地区流感病毒全基因组序列的特性与变异特点,为预防控制流感暴发提供参考。方法参照GenBank流感病毒全基因组序列设计分段扩增引物,进行RT-PCR一
【机 构】
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广州市妇女儿童医疗中心病毒研究室,广州市妇女儿童医疗中心呼吸疾病国家重点实验室,
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目的研究2010年与2011年广州地区流感病毒全基因组序列的特性与变异特点,为预防控制流感暴发提供参考。方法参照GenBank流感病毒全基因组序列设计分段扩增引物,进行RT-PCR一次扩出全基因组序列后,再分段扩增病毒各基因片段,PCR产物直接进行序列测定,用ClustalW/X、DNASTAR、MEGA5.0等软件分析基因组序列。结果克隆了4株广州株流感病毒全基因组序列,将4株广州株流感病毒与墨西哥株和中国四川株全基因组核苷酸序列进行ClustalW比较,发现除PB2片段为98%外,其他各片段均为99%,将基因组序列与北美地区和欧亚地区的猪流感进行CLUSTALW比较,广州株GZ49号基因组的第1、2、3、4、5和第8片段与北美和亚洲地区H1N2型猪流感具有94%～95%相似性,广州株GZ49号基因组的第6和7片段与欧亚大陆的H1N1型猪流感病毒同源性分别为90%～93%和94%～95%;对4株病毒PB2、PB1、PA片段进行了点突变分析,其中4株病毒在PB2基因均出现的位点突变为D195 N、R293 K、V344 M、I354L、V731I。结论 4株广州株新甲流病毒(H1N1)与墨西哥株和中国四川株全基因组具有很高同源性,这4株流感病毒很可能是起源于同一株病毒;PB2基因变异相对较大,这些氨基酸点突变均是新出现的突变。
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