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目的测定克里米亚-刚果出血热病毒（CCHFV）中国分离株（即新疆出血热病毒，XH-FV）BA66019、BA8402及BA88166糖蛋白（M）基因的全部序列并分析各毒株之间的相互关系。方法 病毒RNA在只与其保守末端互补的特异引物PCM-Tag和随机引物的共同引发下逆转录成Cdna，以单一PCM-Tag和高保真DNA聚合酶扩增出完整的M基因。扩增产物纯化后作为模板进行序列测定，并将所得序列经计算机辅助分析其种系发生与编码策略。结果 XHFV代表株BA6019的M基因与国际原型株IbAr10200的M基因比较多5个碱基，为5365bp；比BA8402、BA88166多4个碱基，即5364bp。3株XHFV长ORF起始于M基因的第78位碱基，比IbAr10200株提前15bp。编码的前体蛋白共1689个氨基酸，比IbAr10200株多6个。4株病毒之间核苷酸序列的同源性分别为：80.9％（IbAr10200-BA66019），80.2％（IbAr10200-BA8402），80.2％（IbAr10200-BA88166），83.7％（BA66019-BA8402），83.6％（BA66019-BA88166），99.0％（BA8402-BA88166）；对应的氨基酸序列的同源性分别为85.1％，86.3％，86.6％，87.8％，88.0％，98.8％。它们与Dugbe病毒在核苷酸和氨基酸的同源性较低，大约是55％和37.7％。结论 XHFV BA66019、BA8402和BA88166与国际原型株IbAr10200的M基因在进化上形成各自单独的分支，人源分离株BA88166可能是来自蜱的BA8402株的变异株，提示20世纪80年代在新疆疫区可能只流行一种XHFV。