【摘 要】
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目的汇总分析肝癌易感基因研究文献,并通过生物信息学方法筛选关键基因,为进一步的研究提供参考。方法检索Embase、Pubmed和BIOSIS Preview 3大文献数据库2001-01-2014-01相
【机 构】
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南方医科大学附属佛山医院肿瘤内科,南方医科大学附属佛山医院肝病科,南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心,
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目的汇总分析肝癌易感基因研究文献,并通过生物信息学方法筛选关键基因,为进一步的研究提供参考。方法检索Embase、Pubmed和BIOSIS Preview 3大文献数据库2001-01-2014-01相关文献,基于文献挖掘的方法统计肝癌易感基因,使用生物信息学方法对于易感基因进行分析。结果纳入相关文献共708篇,研究显示近3年论文发表增长明显。文献涉及201个基因,其中不同分级的基因本体论(Gene Ontology,GO)分类741种,京都基因与基因组百科全书数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路66种,这些基因主要与细胞损伤修复、免疫反应、细胞周期调节、炎症反应、DNA损伤修复、凋亡和抗原递呈等有关。KEGG通路主要是参与细胞受体信号传导通路、细胞周期调节、毒物降解、氨基酸和脂肪酸代谢等。在线STRING软件构建其中189个可翻译成蛋白的蛋白与蛋白相互作用网络图,提示这些基因的表达产物大部分存在密切的相互作用关系。进一步运用Cytoscape软件将STRING软件所构建的蛋白网络图可视化及量化,筛选出11个关键基因。结论通过对肝癌易感基因相关文献的文献计量学分析,对该研究领域的研究现状及发展趋势有了系统的认识。肝癌易感性相关基因种类繁多,针对关键基因的大样本研究及网络化的基因分析是未来的研究方向。
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