拟南芥和酿酒酵母来源的磷脂∶甘油二酯酰基转移酶与底物的潜在结合位点分析

来源 :中国油料作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zhhs555

【摘要】

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为了探究拟南芥和酿酒酵母来源的磷脂:甘油二酯酰基转移酶(PDAT)在油脂积累过程中与底物相互作用的机制,本研究利用蛋白三维结构模拟、分子对接等生物信息学手段对植物、真菌

【作者】

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王炼黄庭轩罗玲万霞

【机构】

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中国农业科学院油料作物研究所,农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室,油料油脂加工技术国家地方联合工程实验室,油料脂质化学与营养湖北省重点实验室

【出处】

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中国油料作物学报

【发表日期】

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2018年6期

【关键词】

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拟南芥酿酒酵母磷脂:甘油二酯酰基转移酶磷脂分子对接 Arabidopsis thaliana Saccharomyces cerevisiae PDAT

【基金项目】

：

中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2013-OCRI),十三五重点研发计划(2016YFD0501209-01).

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为了探究拟南芥和酿酒酵母来源的磷脂:甘油二酯酰基转移酶(PDAT)在油脂积累过程中与底物相互作用的机制,本研究利用蛋白三维结构模拟、分子对接等生物信息学手段对植物、真菌等来源的PDAT进行蛋白进化关系分析以及PDAT与特定底物的分子对接分析。通过模拟PDAT和磷脂分子的空间对接模型,预测出底物和蛋白空间互作的多个关键氨基酸位点。基于多种磷脂分子和拟南芥PDAT(AtPDAT)的分子对接和氨基酸序列比对,AtPDAT氨基酸序列中的W153,E310,D313,V627可能对蛋白质和底物结合发挥重要作用。该结

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