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目的
基于线粒体16S rDNA序列对深圳水库区双脐螺进行分子鉴定。
方法以双脐螺基因组DNA为模板,聚合酶链反应扩增16S rDNA目的基因片段,并以pMD18-T载体克隆后进行序列测定,采用BLAST和MEGA4软件分析序列特征。
结果双脐螺线粒体16S rDNA扩增片段大小约为466 bp;测定序列与GenBank中1株巴西藁杆双脐螺(Biomphalaria straminea,B. straminea)同源性为99%;与3株库恩双脐螺(B. kuhniana)同源性均为98%;与1株中介双脐螺(B. intermedia)和1株双脐螺(B. edisoni)的同源性分别为95%和94%。深圳水库区2株双脐螺与巴西藁杆双脐螺(序列号AY030213.1 )的遗传距离为0;基于16S rDNA序列,采用MEGA4软件作系统发生分析,以邻位连接法(NJ)和非加权组平均法(UPGMA)构建的系统发生树,水库区双脐螺与该藁杆双脐螺属于同一个分支。
结论根据16S rDNA序列特征,深圳水库区双脐螺可归类为藁杆双脐螺。