【摘 要】
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目的通过生物信息学方法分析重型颅脑损伤(sTBI)病人外周血微小RNA(miRNA)的靶基因及功能。方法从GEO数据库中检索获取s TBI病人和对照组外周血的基因芯片数据,应用生物信息
【机 构】
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上海交通大学医学院附属第九人民医院神经外科,上海交通大学医学院创伤医学研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金(81772059)
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目的通过生物信息学方法分析重型颅脑损伤(sTBI)病人外周血微小RNA(miRNA)的靶基因及功能。方法从GEO数据库中检索获取s TBI病人和对照组外周血的基因芯片数据,应用生物信息学方法筛选差异表达的miRNA,并进行靶基因预测和生物学功能及信号通路分析,构建miRNA及靶基因的调控网络。结果检索得到芯片GSE21854,筛选得到145个差异表达的miRNA,预测得到靶基因共580个。这些靶基因的功能主要为细胞增殖负性调控、转换生长因子β受体信号通路负性调控等,主要分布在Ras信号通路、转换生长因子β
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