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球虫寄生于犬的小肠黏膜上皮细胞内，以无性繁殖多代，产生许多新裂体芽胞，经过若干裂体生殖后，进行有性繁殖，形成很多大孢子和小孢子。大、小孢子进入肠管内，在肠管内结合，受精后的大孢子为卵囊，随粪便排出体外。卵囊在适宜的条件下，若干天后即可完成孢子发育。此时卵囊内含有2个孢子囊，每个孢子囊内有4个子孢子。孢子化的卵囊具有感染性，当犬吞食孢子化卵囊后即可感染。