海关总署党组严格执行《中央国家机关贯彻落实全面从严治党要求实施方案》（以下简称《方案》），重新整合党建工作职能，直属机关党委全面履行全国海关党建工作领导小组办公室职责、充分发挥海关政治工作中的组织协调作用以及督促“两个责任”落实，协调推动海关党风廉政建设。
　　直属机关党委全面履行全国海关党建工作领导小组办公室职责
　　《方案》对中央国家机关各部门落实全面从严治党要求提出了一系列新要求、新举措，既是新形势下彰显中央国家机关特点的大胆创新，也是近年来特别是十八大以来机关党建工作经验的系统总结。海关总署党组认真学习领会《方案》精神，以《方案》为指导，对原有全国海关党建管理体制重新整合，成立全国海关党建工作领导小组，海关总署党组书记担任组长，相关署党组成员任副组长。
　　全国海关党建工作领导小组将办公室设在直属机关党委，明确其职责是：研究落实领导小组部署，拟定党建工作规划、文件、制度和措施方案;组织推动落实各项工作部署并开展检查督办;组织开展调查研究;组织协调有关基层党组织共同完成从严治党各项工作等。这一新的定位进一步强化了直属机关党委在推动海关系统党的建设中的职能作用。
　　海關实行垂直管理，全国海关党建工作领导小组统领总署机关和海关系统两个战线，直属机关党委作为办公室，主动接受中央国家机关工委领导，能够把工委的新要求和新经验及时应用于海关党建工作，同时又能及时总结海关系统的党建成果，吸收广大基层党组织的经验，运用到总署机关党建工作中，实现了上下联通，优势互补。
　　直属机关党委充分发挥海关政治工作中的组织协调作用
　　海关总署设立政治部，在总署党组领导下，组织全国海关开展政治工作，主管全国海关思想政治工作;指导全国海关领导班子建设和干部人事管理工作;领导全国海关政治机关和政治工作队伍建设，组织全国海关教育培训工作;推动全国海关机关党组织建设，负责总署机关党的建设工作，指导海关系统党的建设。
　　直属机关党委和人事教育司等部门为政治部主要组成部门。机关党委常务副书记（政工办主任）、人教司司长同时任政治部副主任，同时人教司司长也任机关党委副书记。机关党委常务副书记通过参加政治部办公会、例会等工作会议，参与管理海关思想政治建设和干部人事管理工作，使党建工作和干部人事工作紧密结合，有效提高了抓党建工作的力度和效率。
　　工委《方案》下发后，海关总署将原政治部办公室职责划入直属机关党委，明确机关党委负责研究制定海关系统政治工作的制度、计划;指导直属海关政治部有关工作;起草总署政治部综合性文件，强化督办落实，加强内部协调等工作，进一步强化直属机关党委在政治工作中的组织协调推动作用。
　　直属机关党委督促“两个责任”落实，协调推动海关党风廉政建设
　　按照中央纪委部署，总署党组将海关总署党风廉政建设和反腐败工作领导小组办公室职责和党风廉政建设日常工作划入直属机关党委，负责提出全国海关党风廉政建设工作规划;研究制定总署党组和海关系统落实党风廉政建设责任制工作制度、措施并组织实施;协调推进“两个责任”落实工作等。职能划转后，直属机关党委承担的总署机关、海关系统落实党风廉政建设的职责进一步强化。
　　为适应新职责新要求，总署党组在直属机关党委增设党风廉政建设处，具体负责督促党风廉政建设主体责任的落实，组织推动全国海关行风建设和纠风工作，组织实施廉政教育等职责任务。党风廉政建设处与原有机关纪委办公室职责相互补充，统筹开展工作，实现了对总署机关和海关系统同抓同管，同步落实，把直属机关党委在从严治党中的协调、推进、教育、监督和引领责任切实落到实处。