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肠道菌群对动物的营养、生理、免疫等方面起重要作用，其组成、结构、稳定性及与生理功能的关系已成为探讨食物如何通过肠道微生物影响人体健康的关键。文章旨在总结与分析现代分子生物学技术如RFLP、SSCP、PCR～DGGE／TGGE、ERIC—PCR、核酸分子杂交和基因芯片技术在肠道微生态研究中的优缺点，为深入研究肠道微生态提供了快速、准确、可行的方法。