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目的了解丙型肝炎病毒(HCV)基因型在四川(川)、云南(滇)、贵州(黔)等中国西南地区汉族丙型肝炎患者中的分布及临床特征,为丙型肝炎的防治提供依据。方法对221例来自川、滇、黔地区的丙型肝炎患者,采用焦磷酸测序法进行HCV基因分型并分析不同基因型丙型肝炎致病性的差异。结果 1216例HCVRNA阳性的丙肝患者被成功分型,共发现1、2、3、6等4种常见基因型和1a、1b、2a、2b、3a、3b、6a等7种常见基因亚型,其所占比例为:1a型5.1%(11/216)、1b型36.1%(78/216)、2a型3.7%(8/216)、2b型0.9%(2/216)、3a型7.4%(16/216)、3b型27.8%(60/216)、6a型17.1%(37/216),此外,还发现其他少见亚型(4a/6n)共4例,占1.9%(4/216)。2川、滇、黔分布前3位的基因亚型分别是3b、1b、6a和3b、1b、2a/3a及1b、6a、3b;男、女患者比例最高的亚型分别是3b(33.1%)和1b(48.3%);>40岁患者以1b(39.8%)、3b(18.6%)、6a(15.9%)为主;<40岁患者以3b(37.9%)、1b(32.1%)、6a(18.4%)为主;感染方式以输血(血制品)40.1%为主,其他及不明原因者也占较大比例(33.8%)。3急性丙型肝炎、慢性丙型肝炎、丙肝后肝硬化和肝癌4种临床类型的丙型肝炎均以1b型比例最高,其次是3b、6a型;1b型患者的HCV载量及肝功能损害指标均高于其他亚型患者(P<0.05)。结论川、滇、黔等中国西南部地区HCV-RNA阳性的汉族HCV感染者以1b、3b、6a为优势基因,且呈多样化分布;HCV载量较高的1b亚型,可能更容易导致患者肝功能的损害以及丙型肝炎的慢性化、肝脏的纤维化和癌变。