棒瑚菌子实体不同发育时期的转录组分析

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【摘要】

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旨为研究棒瑚菌子实体幼菇期(CP-1)和成熟期(CP-2)基因表达的差异,探索棒瑚菌在生长发育过程中的关键基因和关键代谢通路。采用RNA-Seq测序技术对棒瑚菌子实体进行测序并进行

【作者】

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唐贤丁祥董明明朱淼宋志强侯怡铃

【机构】

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西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,西华师范大学环境科学与工程学院

【出处】

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生物技术通报

【发表日期】

：

2019年10期

【关键词】

：

棒瑚菌 RNA-Seq测序差异表达基因代谢通路 Clavariadelphus pistillaris RNA-Seq sequence different

【基金项目】

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四川省科技厅应用基础重点项目(2018JY0087),四川省科技厅重点研发项目(2018NZ0055),四川省教育厅重大培育项目(16CZ0018),南充市科技局项目(16YFZJ0043)

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旨为研究棒瑚菌子实体幼菇期(CP-1)和成熟期(CP-2)基因表达的差异,探索棒瑚菌在生长发育过程中的关键基因和关键代谢通路。采用RNA-Seq测序技术对棒瑚菌子实体进行测序并进行生物信息学分析。测序结果显示,共获得8.78 G(CP-1)和8.28 G(CP-2)的分析数据(Clean reads)。KOG功能注释和GO富集分析显示新陈代谢过程、细胞和细胞组分以及氧化还原酶活性是棒瑚菌子实体发育过程中的关键基因门类。基因表达水平分析结果显示,多酚氧化酶、核糖体、糖苷水解酶家族等基因为棒瑚菌子实体幼菇期(

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