梅花PmICE1基因的克隆及低温条件下的表达

来源 :东北林业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:laoxu111
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以梅花(Prunus mume)品种‘三轮玉蝶’为试材,根据苹果(Malus domestica)MdCIbHLH1基因序列在梅花基因组数据库中搜索同源序列并设计引物,通过PCR、RT-PCR获得ICE1基因的DNA、cDNA全长序列。cDNA全长1 626 bp,含有完整的开放阅读框,编码541个氨基酸,基因编码区上存在3个内含子和4个外显子,含有bHLH区、富S区、核定位信号区(NLS)和转膜区。ExSAPy在线预测编码蛋白呈亲水性,亚细胞定位预测目的蛋白位于细胞核(98%)。BLAST分析结果表明,其cDNA序列及推导的氨基酸序列均与苹果、茶(Camellia sinensis)、甜杨(Populus suaveolens)、枳(Poncirus trifoliata)等物种的ICE1具有较高同源性,推断克隆到的cDNA可能是梅花ICE1基因,命名为PmICE1。实时荧光定量分析结果表明,在4℃低温胁迫下,PmICE1基因表达量随胁迫时间的延长呈上升趋势,16 h时达到峰值,说明该基因在低温胁迫下呈上调表达。
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