2013—2017年西安市流行麻疹病毒的基因特征分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong545
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

了解2013—2017年西安市麻疹流行毒株核蛋白(nucleoprotein,N)的基因变异。

方法

疑似麻疹病例的咽拭子标本经Real-time RT-PCR检测为麻疹病毒核酸阳性的,在Vero-SLAM细胞上分离病毒,提取毒株核酸,用One-Step RT-PCR法扩增毒株和Ct值低的咽拭子核酸的N基因,测序后分析。

结果

共获得30条麻疹流行毒株N基因羧基末端序列,经鉴定均为H1a亚型。流行毒株之间的核苷酸和氨基酸的同源性分别为97.3%~100%和96.7%~100%,其与疫苗株S191为91.3%~92.2%和87.3%~90.0%,与疫苗株C47为92.2%~92.7%和88.0%~90.7%。西安市流行毒株与安徽省、甘肃省、山东省、河南省、吉林省野病毒的同源性高于山西省、四川省、湖南省与广东省。流行毒株与两条疫苗株氨基酸序列比较,变异较多(熵值较高)的位点是422、457和497、467和500。467位点的突变只存在于2017年。dN/dS=0.199,未发现正选择位点。

结论

2013—2017年西安市麻疹流行毒株的优势基因型是H1a亚型,近两年病毒基因多样性在减少,应加强病原学监测,为麻疹消除提供证据。

其他文献
目的制备抗H7N9神经氨酸酶(neuraminidase,NA)的嵌合抗体,初步鉴定其活性与功能特点。方法采用基因工程技术,将小鼠杂交瘤技术获得的2株特异性靶向流感病毒A/Anhui/1/2013(H7N9) NA的单克隆抗体VH、VL基因分别克隆入嵌合抗体表达载体VH Express及VL Express中,共转染293T细胞后,表达纯化获得抗H7N9 NA的嵌合抗体,对抗体活性及功能进行鉴定。
目的通过基因工程技术表达我国猪源P[6]基因型轮状病毒(rotaviruses,RVs)GST-VP8*-Z84蛋白,研究该蛋白与寡糖、唾液受体的结合特征。方法以猪源P[6]型RV Z84为研究对象,利用GST大肠杆菌表达系统及亲和层析、凝胶过滤层析法纯化得到病毒GST-VP8*-Z84蛋白,通过ELISA唾液结合实验及寡糖结合实验分析该基因型与唾液及寡糖受体的结合特征。结果猪源P[6] GST-
目的探究血清N-甲基-天冬氨酸受体(NMDAR)抗体水平、脑干听觉诱发电位(BAEP)与磁共振成像(MRI)对鉴别诊断儿童病毒性脑炎及抗NMDAR脑炎的临床价值。方法回顾性分析68例脑炎患儿临床资料,确诊为病毒性脑炎者纳入V组(n=52),确诊为抗NMDAR脑炎者纳入N组(n=16)。比较两组患儿临床特征、血清NMDAR抗体水平及BAEP、MRI检查结果差异。结果V组年龄、病程、行为异常率、睡眠障
目的探讨保肝药物对APRI诊断慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者肝纤维化能力的影响。方法入组经皮肝组织穿刺病理学检查诊断为CHB的患者为研究对象,根据患者用药情况分为保肝药物实验组及无保肝药物应用的对照组;按常用保肝药物种类进行分组,并以肝纤维化程度分期及年龄为匹配条件从无保肝药物应用的患者中分别随机入组病例为各保肝药物组的对照组。以肝组织病理学诊断为标准,采用受试
目的对云南省2010—2013年病毒性脑膜炎(viral meningitis,VM)病例中分离到的9株埃可病毒30型(echovirus 30, E-30)VP1编码序列基因特征进行分析。方法对云南省2010—2013年VM病例中分离到的9株E-30病毒的VP1区进行基因扩增和测序;从GenBank下载E-30病毒参考株(reference)和原型株(prototype)VP1编码序列作为参考序
目的研究北京市朝阳区感染性腹泻患儿中诺如病毒(Norovirus,NoV)的分子流行病学特征。方法针对北京市朝阳区2011年4月至2017年12月收集的5岁以下腹泻患儿粪便标本,利用PCR方法检测其中NoV聚合酶-衣壳区,并对扩增产物进行序列测定、NoV系统进化分析和型别鉴定,结合结果进行统计分析。结果完成对151例NoV阳性标本的扩增和测序,男女比例为2.28∶1,平均年龄1.72岁,检出较高的
目的分析诺如病毒(Novirus, NoV)GII.4型济南JN010株基因组序列及其特征。方法根据文献并结合PrimerSelect软件设计7对引物,利用RT-PCR方法获得NoV济南JN010株全基因组序列,应用Lasergene7.1、MEGA5.2等软件对基因组序列进行遗传进化、同源比对分析,建立ORF1及ORF2基因系统进化树。并根据VP1氨基酸序列进行突变分析。结果NoV JN010株
目的探究依达拉奉联合抗病毒药物对30例成人病毒性脑炎的治疗效果。方法选取福建医科大学附属第一医院60例成人病毒性脑炎患者为研究对象,根据住院号随机分为对照组及观察组,各30例。对照组给予常规抗病毒治疗,而观察组予以抗病毒药物联合依达拉奉治疗。并将同期入院体检的30例健康者纳入健康组。记录观察组与对照组临床疗效及临床表现(发热、头痛、呕吐、脑电图异常)恢复正常时间,并比较观察组与对照组治疗前及治疗2
载脂蛋白B mRNA编辑酶3G(apolipoprotein B mRNA-editing enzyme 3G, APOBEC3G)属于载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽家族(apolipoprotein B mRNA editing enzyme-catalytic polypeptide family, APOBEC family),可以通过胞嘧啶脱氨机制和非胞嘧啶脱氨机制来抑制人类免疫缺陷病
目的通过检测乙型肝炎表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBsAg)阳性孕妇早期流产的绒毛组织中与乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染相关的指标,评估妊娠早期宫内感染的发生情况及可能的影响因素。方法以45例HBsAg阳性孕妇早期流产的绒毛组织和血液标本为研究对象,应用荧光定量qRT-PCR方法,对HBV DNA进行测定,并与血液中HBV DN