ARHGAP29内含子区域SNP位点的生物信息学分析

来源 :口腔生物医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：qiufeng115

【摘要】

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目的:通过生物信息学方法对全基因组关联分析(GWAS)得到的ARHGAP29内含子区域的单核苷酸多态性(SNP)进行深度分析,对目标SNP进行信息注释及功能预测。方法:根据病例对照实验

【作者】

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侯宇转阮文彦段小红黄永清

【机构】

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宁夏医科大学口腔医学院,军事口腔医学国家重点实验室,宁夏医科大学总医院口腔医院口腔颌面外科

【出处】

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口腔生物医学

【发表日期】

：

2020年3期

【关键词】

：

唇腭裂 ARHGAP29 单核苷酸多态性长链非编码RNA 生物信息学 cleft lip and palateARHGAP29SNPLncRNAbioinfo

【基金项目】

：

国家自然科学基金(8196030661,81974145,81771052)

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目的:通过生物信息学方法对全基因组关联分析(GWAS)得到的ARHGAP29内含子区域的单核苷酸多态性(SNP)进行深度分析,对目标SNP进行信息注释及功能预测。方法:根据病例对照实验筛选出4个有统计学意义的SNP位点,运用美国国家生物技术信息中心(NCBI)中的SNP数据库、3D SNP数据库,RegulomeDB数据库、LncSNP2.0数据库等多种信息分析方法对SNP的生物学信息及相关长链非编码RNA(LncRNA)的功能进行预测。结果:4个SNP(rs3814019、rs72964308、rs17

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