印度南瓜高通量转录组测序与数据分析

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【目的】获得印度南瓜转录组信息特征,为后续印度南瓜基因功能、分子标记、次生代谢途径及其调控机制等分析研究提供科学依据。【方法】本文以印度南瓜叶片为研究对象,采用Illumina HiSeqTM 2000进行高通量转录组测序并进行数据分析。【结果】转录组测序共获得26083711个高质量片段(clean reads),经Trinity de novo组装获得68073条Unigenes,平均长度1236.73 nt。BLAST分析显示分别有37542(占总Unigenes的98.34%)、23946(62.
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