【摘 要】
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以从树肝脏mRNA逆转录得到的Ⅰ链cDNA为模板,运用SMART RACE PCR技术,扩增得到树载脂蛋白E(apoE)cDNA序列,并推导出apoE蛋白质的氨基酸序列.利用分子生物学软件包PCGENE对氨
【机 构】
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中国医学科学院基础医学研究所,中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室,北京,100005
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以从树肝脏mRNA逆转录得到的Ⅰ链cDNA为模板,运用SMART RACE PCR技术,扩增得到树载脂蛋白E(apoE)cDNA序列,并推导出apoE蛋白质的氨基酸序列.利用分子生物学软件包PCGENE对氨基酸序列和二级结构进行分析和比较.结果表明,树 apoE cDNA序列(作为新基因已被GenBank接收,登录号为AF 303830)由1 138 bp构成,其中5＇非翻译区64bp,3＇非翻译区135bp,939 bp组成一个完整开放阅读框架,与人apoE cDNA的同源性为86%.编码313个氨基酸组成的apoE前体,包含18个氨基酸构成的信号肽和295个氨基酸组成的成熟蛋白.与人apoE氨基酸序列的同源性为78%.树 apoE与人及其它种属动物apoE在氨基酸组成上相近,但比人apoE少4个氨基酸,比动脉粥样硬化易感动物家兔apoE多2个氨基酸.经Garnier法预测,树 apoE蛋白二级结构与人apoE相似,螺旋构象(helical)69.9%,伸展构象(extended)16.6%,转角构象(turn)6.0%,无规则卷曲(coil)7.6%.
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