【摘 要】
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目的 了解1株多耐药肺炎克雷伯菌JM45株对氨基糖苷类药物耐药的遗传学背景.方法 采用罗氏454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM45株做全基因组测序(完成图),再分析氨基糖苷类修饰酶基因、16S核糖体RNA(rRNA)甲基化酶基因检测状况,并和其他已经完成全基因组测序的革兰阴性菌作比较基因组学分析.结果 最终得到肺炎克雷伯菌JM45株1条完整的基因组(染色体)序列及2条质粒序列.基因组(染色体)序
【机 构】
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目的 了解1株多耐药肺炎克雷伯菌JM45株对氨基糖苷类药物耐药的遗传学背景.方法 采用罗氏454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM45株做全基因组测序(完成图),再分析氨基糖苷类修饰酶基因、16S核糖体RNA(rRNA)甲基化酶基因检测状况,并和其他已经完成全基因组测序的革兰阴性菌作比较基因组学分析.结果 最终得到肺炎克雷伯菌JM45株1条完整的基因组(染色体)序列及2条质粒序列.基因组(染色体)序列为5 273 812 bp(GC含量65.8％),质粒1序列为317 156 bp(GC含量53.0％),质粒2序列为12 209 bp(GC含量55.3％).在质粒1中发现了氨基糖苷类腺苷转移酶基因aadA2(KPN_5186)和16S rRNA甲基化酶基因rmtB(KPN_5243).由全基因组测序可见aadA2基因位于整合子中,排序为int ⅠA-dfrA12 aadA2 orf3/qacE;rmtB基因位于转座子中,排序为tnpA-TEM1 rmtB.结论 携带aadA2和rmtB基因是JM45株耐氨基糖苷类药物的主要原因。
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