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针对目前中小型水厂的需求及实际情况,以FPGA作为核心控制单元,并在其中定制Nios Ⅱ软核处理器,设计了一种新型污水处理数据采集系统。此系统具有开关量和模拟量的采集及输出功能,通过SPI总线与上位机通信。通过移植μC/OSⅡ嵌入式实时操作系统,实现多任务调度。经过实验验证,系统实现了预期功能,具有良好的灵活性和性价比。