非格子模型的蛋白质设计方法

来源 :北京工业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：chenyuanliang520

【摘要】

：

为了克服双重蒙特卡罗方法用于较大分子体系及非格子模型的困难,提出了一个基于相对熵的蛋白质设计的简单方法.利用非格子模型,以16个处于天然稳定态的真实蛋白质为目标结构

【作者】

：

刘赟王存新王宝翰陈慰祖

【机构】

：

北京工业大学,中国科学院

【出处】

：

北京工业大学学报

【发表日期】

：

2004年1期

【关键词】

：

蛋白质设计蛋白质逆折叠相对熵 protein design inverse protein folding relative entropy

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为了克服双重蒙特卡罗方法用于较大分子体系及非格子模型的困难,提出了一个基于相对熵的蛋白质设计的简单方法.利用非格子模型,以16个处于天然稳定态的真实蛋白质为目标结构进行测试,成功率可达75.9%.与其他利用Monte Carlo方法搜索序列空间的方法相比,该方法更为快速有效,在很大程度上节省了对序列空间的搜索.

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