温控分子动力学研究微管蛋白活性肽链的折叠机制

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运用温控和常温分子动力学方法,研究了微管蛋白活性部位Pep1-28肽链的折叠机制,总模拟时间为380.0ns.对于温控分子动力学,逐渐降温可以清晰显示Pep1-28肽链的折叠途径,发生明显折叠的温度约为550K,其折叠和去折叠可逆机制为U(〉1200K)圮I1(1200-1000K)圮I2(800K)圮I3(600K)圮I4(450K)圮F1(400K)圮F2(300K),其中U为去折叠态构象,I1、I2、I3和I4是折叠过程中的四个重要的中间态构象,F1和F2是两个结构相近的折叠态构象.对于常温(300
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