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对我国浙江近海4个采样点(长江口、嵊泗群岛、舟山群岛、洞头群岛)的147个三疣梭子蟹个体的线粒体DNA16SrRNA部分序列进行了测定和分析,获得其基因片段长度为991bp,共发现14种单倍型,11个核苷酸多态性变异位点。长江口、嵊泗群岛、舟山群岛、洞头群岛4个地方群体的平均核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0.00089和0.565。其中,嵊泗群岛群体的遗传多样性水平最高(核苷酸多样性0.00127,单倍型多样性0.754),长江口群体最低(核苷酸多样性0.00034,单倍型多样性0.322)。长江口与嵊