猪流行性腹泻病毒湖北株的分离鉴定及其s1基因进化分析

来源 :湖北农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:longzhulx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)是猪的肠道传染病病原,主要引起仔猪呕吐、腹泻和脱水,对一周龄内的哺乳仔猪危害最为严重,死亡率可达50%~100%.利用Vero86细胞从湖北某猪场腹泻仔猪小肠病料中分离到一株病毒,经RT-PCR检测、序列比对后确定其为PEDV,命名为HB201503株.设计PEDV s1基因的全长扩增引物,获得该株病毒的s1基因全长序列并进行了进化分析,结果表明该毒株与近年来在GenBank登陆的PEDV s1基因核苷酸序列相似性在91.4%~99.2%,与疫苗株CV777相似性较低,仅为91.8%.通过s1基因进化树分析表明HB201503以及近几年国内分离毒株主要集中在第Ⅰ个亚群,且HB201503株与KM406183(2014,四川)和KM609206(2015,江苏)同源性较高.此外,s1蛋白氨基酸序列比对显示,HB201503与近几年分离毒株及疫苗株CV777均在55-74、157-163位氨基酸出现了连续4个以上氨基酸的缺失或替换,而且HB201503株与CV777及近几年分离毒株相比,还在270-283位氨基酸上出现了1个氨基酸的缺失和10个氨基酸的替换.
其他文献
Background Cardiac arrest is one of the most serious complications of acute myocardial infarction (AMI),especially in the out-of-hospital patients.There is no g
The sewage sludge conditioning process is critical to improve the sludge dewaterability prior to mechanical dewatering.Traditionally,sludge is conditioned by ph
Background SRY-related HMG-box 17 (SOX17) encodes a member of the SOX (SRY-related HMG-box) family of transcription factors involved in the regulation of embryo
Background The impact of home monitoring system in the early detection of ventricular arrhythmia and inappropriate shock in daily work is not clear.The aim of t
本文作者根据在安阳市土地利用更新调查外业调查和数据库建设工作中的经验,对数据库建设的目标、技术路线、建设流程、主要功能作了介绍,对数据库系统的应用进行了总结,并提
Background As two novel adipocytokines,chemerin and apelin play a key role in the pathological process of insulin resistance (IR),glucose metabolism and obesity
由于两岸的法律制度不同,因此,在进行两岸经济文化交流时不可避免出现误会。本文通过比较两岸要约的不同来说明这一点,以期使两岸双方的相关人士在进行经济交流时能有效地避
孤岛油田是一个重质稠油油田,馆陶组原油相对密度大,粘度高,并具有含硫量高、含胶质和沥青质高、凝固点低和含蜡量低等特点.根据原油性质和油层分布将整个孤岛油田划分为中一
介绍了钻探施工偏斜补煤偏心楔的制作、下入方法、施工工艺、钻进方法,提出了偏斜补煤注意事项.通过补救煤层,保证钻孔质量,获得所需地质资料.
Along with its wide anatomical distribution, somatostatin (SST) acts on multiple targets via a family of 5 receptors to produce a broad spectrum of biological e