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目的 评价宏基因组二代测序(mNGS)在肺部感染患者中病原学诊断的临床价值.方法 回顾性分析2018年1月至2020年7月在我院住院期间完善了BALF-mNGS检查的59例肺部感染患者,根据是否存在基础疾病,分为有基础疾病组及无基础疾病组,比较mNGS及常规检测方法的病原体检测阳性率、采信率等指标.最后比较不同病原体的mNGS检测阳性率.结果 无论是基础疾病组还是无基础疾病组,mNGS检测病原体的阳性率较多种常规方法联合高(P<0.05),且BALF-mNGS检测阳性率较BALF培养高(P<0.05).mNGS的临床采信率较常规检测方法高(P0.05).mNGS检测细菌的阳性率较常规方法高(P0.05);对于混合性肺部感染,联合mNGS和常规方法的检出率显著较常规方法高(P<0.05).结论 mNGS能有效提高病原体检测的阳性率及临床采信率,是病原学精准性诊断的具有潜力的新方法,而对于混合性肺部感染mNGS联合常规方法的病原检出相对更全面.