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藻类是水生生态系统中的敏感物种。在环境生物学研究中, 基因转录水平通常作为衡量基因表达水平变 化的指标。研究建立了定量PCR技术（Real-time PCR）检测小球藻基因转录变化的研究体系。以3个主要光合作用基因（psaB、psbC、rbcL）为靶标基因, 研究了除草剂草丁（Glufosinate）、阿特拉津（Atrazine）和禾草灵（Diclofop-methyl）对基因转录的影响, 结果表明3种供试药物对小球藻光合作用基因psbC和rbcL相对表达量有显著地抑制作用。这表明Real-time PC