目的:探讨子宫颈微生态与宫颈鳞状上皮内病变（squamous intraepithelial lesion，SIL）的关系。方法:选取2019年3月至5月南京医科大学附属无锡第二医院体检中心体检的和妇科就诊的12例子宫颈正常受试者（37~47岁），21例低度鳞状上皮内病变（low-grade squamous intraepithelial lesion，LSIL）患者（39~48岁），5例高度鳞状上皮内病变（high-grade squamous intraepithelial lesion，HSIL）患者（38~45岁）和3例宫颈鳞癌患者（42~43岁），填写调查问卷、行子宫颈检查，同时使用下一代测序技术（next generation sequencing，NGS）分析子宫颈分泌物的微生态，生物信息学分析NGS结果。根据NGS的人乳头状瘤病毒（human papilloma virus，HPV）检测结果将受试者分为HPV阴性组、低危HPV（low-risk HPV，lrHPV）、16/18型高危HPV（high-risk HPV，hrHPV）和其他hrHPV感染组。分析数据的韦恩图、微生态的多样性、物种的相对丰度和共现性以及受试者工作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲线。结果:所有受试者子宫颈分泌物共获得种属水平微生态物种909种，各组之间有重叠。在不同宫颈病变受试者中，总HPV感染率、16/18型hrHPV感染率和其他hrHPV感染率差异无统计学意义（n P均>0.05）。按HPV感染分组，16/18型hrHPV和其他hrHPV感染患者的子宫颈微生态多样性升高（n U分别为39.00和43.00，n P均<0.05），而各组之间卷曲乳酸杆菌相对丰度无差异（n H=4.37，n P=0.213 6）。按子宫颈状况分组，子宫颈病变受试者子宫颈微生态多样性（n H=14.60，n P=0.002 2）升高，卷曲乳酸杆菌丰度下降（n H=13.98，n P=0.000 8）。在微生态物种中，支原体、衣原体和B族链球菌具有共现性；惰性乳酸杆菌、阴道加德纳菌、阿托波菌和二路普氏菌具有共现性。以卷曲乳酸杆菌相对丰度作为SIL诊断指标，其ROC曲线下面积（area under ROC curve，AUC）为0.874[95%置信区间（confidence interval，n CI）：0.732~0.957]，卷曲乳酸杆菌和詹氏乳酸杆菌以及支原体联合诊断SIL的AUC为0.943[95n %CI：0.822~0.991]。n 结论:子宫颈卷曲乳酸杆菌相对丰度下降和微生态多样性升高可能与HPV感染和子宫颈病变有关；NGS数据简化后可能有助于SIL诊断。