【摘 要】
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肝癌是发生于肝脏组织中的一种常见恶性肿瘤。肝癌具有初期隐匿且临床症状不典型,中后期发展迅速的特点,其发生率和死亡率近年来不断升高,严重威胁着人类的生命和健康。对肝
【机 构】
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内蒙古科技大学生命科学与技术学院;
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肝癌是发生于肝脏组织中的一种常见恶性肿瘤。肝癌具有初期隐匿且临床症状不典型,中后期发展迅速的特点,其发生率和死亡率近年来不断升高,严重威胁着人类的生命和健康。对肝癌发生发展过程中的关键分子标记物的研究,对临床诊断具有重大的意义。TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目,即美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱计划,为系统分析癌症组织提供了海量的实验数据。本工作使用edgeR工具分析取自TCGA-LIHC(Liver Hepatocellular Carcinoma)项目的肝细胞癌组织和正常组织基因和miRNA表达谱数据,得到肝细胞癌和正常组织的差异表达基因和miRNA。使用WGCNA软件包对得到的差异表达基因和miRNA进行共表达网络分析,构建了27个与细胞周期、防御反应、甲基化等GO分类密切相关的网络模块;正常样本和肝细胞癌样本网络模块的保守性分析发现正常样本和肝细胞癌样本的共表达模式差异显著。最后探索了构建的共表达网络模块与肝细胞癌患者临床信息的关联,发现了11个与肝细胞癌患者生存时间、癌症分期等临床信息显著相关的网络模块及227个(226个基因和1个miRNA)与肝细胞癌分期显著相关的网络节点。
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