内生真菌(endophytic fungi)(Petrini,1991)是指在生活史的某一个阶段存在于健康植物组织内部,不会引起寄主植物明显病症或者对寄主植物造成明显伤害的真菌。从目前的研究来看,内生真菌是一种普遍存在于寄主植物体内的微生物类群,全世界至少已在80个属290种禾本科植物中发现有内生真菌,非禾本科植物中内生真菌有130多个属200多种。其中禾本科植物内生真菌主要是子囊菌及其无性型,而非禾本科植物的内生真菌主要包括子囊菌门、接合菌门以及少数担子菌门。本实验从河北省保定温仁镇25年生的苹果树上采集了健康的苹果树皮,采样部位为主干、主枝、侧枝、小枝以及木质部,按常规的方法进行表面消毒并验证确定表生菌已经被消除后用PDA、MEA和Martin 3种培养基对内生真菌进行分离。经过分离培养,共得到了126株内生真菌,其中MEA和Martin培养基分离得到的内生真菌的种类明显多于PDA。经鉴定这些内生真菌分属于13个属,不同部位内生真菌的数量和种类有明显差别,其中主干14株,分属于4个属;主枝43株,分属于8个属;侧枝33株,分属于5个属;小枝31株,分属于4个属;木质部5株,分属于2个属。Alternaria sp.和Setosphaeria sp.在苹果枝干的任何部位都存在,其中Alternaria sp.为苹果枝干中内生真菌的绝对优势菌株,占总分离频率的73.3%。Fusarium sp.为苹果主干部位特有的真菌,Nigrospora sp.为木质部特有真菌,Trichoderma sp.只在小枝部位存在。这一结果可能是由于生长年限和表面积等方面的不同而导致不同部位内生真菌的种类和数量存在差异,一般来说生长年限越长内生真菌的数量越多,但是由于多年生的苹果树主干部位腐烂病和轮纹病的发生情况特别严重,腐烂病菌和轮纹病菌属于绝对的优势菌株,可能抑制的其他真菌的生存。用分离到的126株内生真菌与苹果树腐烂病菌进行对峙培养,共有42株菌对苹果树腐烂病菌的生长有抑制作用,占供试菌株的34%,抑制率在40%以上的有24株,均为链格孢属(Alternaria)真菌,关于链格孢属真菌对于苹果树腐烂病菌的拮抗机制尚待进一步研究。