谷子MYB转录因子响应Sclerospora graminicola侵染的生物信息学及表达分析

被引量 : 0次 | 上传用户:chenyanqing
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
谷子白发病可严重降低谷子的产量和品质,谷子MYB转录因子在调控生物胁迫响应中扮演重要的角色。本研究依据课题组前期白发病菌侵染谷子不同时期的转录组数据,获得6个显著差异表达的MYB转录因子,结合ExPASY、GSDS、Phytozome、Prot Comp 9.0和MEGA7.0等软件对其启动子元件、亚细胞定位及系统进化等分析。利用qRT-PCR方法对该6个转录因子的表达模式进行验证。结果表明,通过比较分析6个显著差异表达的MYB转录家族与玉米、水稻、拟南芥MYB家族共同构建的进化树,发现谷子MYB基因家族与玉米、水稻等禾本科聚为一类,与拟南芥亲缘关系较远;亚细胞定位预测结果显示,4个MYB转录因子定位于细胞质中,其余2个主要定位于胞外;顺式作用元件分析,谷子6个MYB转录因子中均含有响应防御胁迫和真菌激发响应、MeJA、脱落酸和水杨酸等作用元件。最后,基于qTR-PCR的差异表达数据进一步验证了MYB转录因子在抗病过程中发挥重要转录调控作用。该研究结果可为今后MYB基因的克隆、功能验证以及开展抗病分子育种提供理论依据。
其他文献
介绍了陕西省林地“一张图”建设方法,提出并解决了“一张图”建设中的坐标系统设置、属性及图形拓扑检查、无缝拼接、海量数据存储等关键技术.
目的:外泌体(Exosomes,Exos)是一种包含了复杂RNA和蛋白质的由细胞分泌的直径为50-150nm的盘状囊泡。由于外泌体可调节受体细胞相关生物活动,并且没有天然或组织工程干细胞移