辐射诱变的兰花叶斑突变体的转录组分析

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兰花叶片具有很高的观赏价值。"叶艺"在园艺学上称为叶部彩斑(variegation)现象,日本学者将叶斑分为5大类共41种。叶艺兰(线艺兰)是指兰科(Orchidaceae)兰属(Cymbidium)植株叶片上镶嵌金黄色、银白色、浓绿色、朱红色、或墨黑的嘴、边、点、线、斑的中国兰。目前市场上的叶艺兰多来自野生兰花天然杂交后代或在长期生长发育过程中的自然变异植株,存在品种选育时间长且艺象不稳定等问题。通过转录组分析,从分子角度探究叶艺兰的形成机制,为挖掘兰花叶斑形成的相关基因和兰花育种提供依据。以黄素花虎头兰(Cymbidium tracyanum)与黄蝉兰(C. iridioides D. Don)F1代杂交的组培苗经60Coγ射线辐射诱变后(6次继代培养)筛选出稳定优良变异后代新品系叶艺兰(命名为TRIR-2)和原杂交苗F1代(命名为TRIR-1)为试材,利用illumina测序技术进行转录组测序和差异表达基因的分析,利用Blast和Orchidstra数据库比对与差异表达Unigene相匹配的CDS,删除假阳性和RT验证后进行差异表达基因的GO功能显著性富集分析和代谢通路(Pathway)显著性富集分析。获得56 013条Unigene,有9 966条非冗余差异表达的Unigene序列,其中3 866条上调表达,6 100条下调表达;对其中2 265条高表达的差异基因进行代谢通路(Pathway)富集分析,获得115个代谢通路,主要表现在植物激素信号转导、类黄酮生物合成、光合作用、过氧化物酶代谢、卟啉和叶绿素代谢等方面。
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