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川村陆蛙是泽陆蛙的一种复合种,其分布区遍布印度到日本等东南亚地区。泽陆蛙在中国自南向北均有分布,且分布范围广,面积大,但我国有关泽陆蛙及其复合种之间的研究相对较少,对于其分类地位一直存在争议。本研究通过普通PCR技术测定泽陆蛙和川村陆蛙的粒体基因组全序列,利用MITOS WebServer来确定线粒体基因结构和排列方式,用tRNAscan-SE构建tRNA的三叶草结构,用RaxML程序和MrBayes 3.1.2程序进行ML和BI分析,构建系统发育树。川村陆蛙线粒体基因组基因排列方式总体上和泽陆蛙相同,均存在典型的两个tRNA-Met基因。同时tRNA-Thr/tRNA-Pro/tRNA-Leu移位到tRNA-Phe上游,而ND5基因则移位到了控制区和tRNA-TPLF基因簇之间。但是在舟山川村陆蛙和部分福建样本的线粒体基因组排列中还发现,在tRNA-His和tRNA-Ser基因后面存在不同程度的tRNA-Ser或tRNA-Leu基因的重复。tRNA-Ser或tRNA-Leu基因均为残基,且序列组成的相似度高。当反密码子环从TCT突变为TTT时,tRNA-Ser变为tRNA-Leu。构建的系统发育树显示泽陆蛙及其复合种可以分为两大支系,分别是广西、广东、贵州以及舟山群岛等地聚为一支,其组内遗传距离范围为0.001-0.039,平均遗传距离为0.017,这表明川村陆蛙在系统发育上和中国东南和南部沿海地区的泽陆蛙关系较近,这可能是由于舟山岛屿上的川村陆蛙沿福建古大陆架进行扩散而形成的。