本文基于高效液相色谱方法分析了黄海冷水团区浮游植物的光合色素组成，并结合CHEMTAX软件估算浮游植物群落结构。结果表明:在2006-2007年四个航次调查期间，浮游植物光合色素和群落结构都存在明显的季节变化规律，黄海冷水团在发育、盛行和衰退时期都对浮游植物群落结构的时空分布有显著地影响。4月，黄海冷水团区受冬季强烈垂直混合的影响，温度、盐度、营养盐等参数表底差异不明显。因温度的回升和合适的营养盐浓度，在胶州半岛以南的区域。发生了硅藻藻华，中心区域叶绿素a高达15mg/1,硅藻比例高达9896，而且整个黄海海区的浮游植物平均生物量在四个季节的航次中最高，硅藻所占百分比也最高。8月，黄海冷水团盛行，水柱温盐层化结构明显，同样浮游植物群落结构也存在明显的垂直分布差异，蓝藻和定鞭金藻主要分布在表层，随深度增加而逐渐减少，而硅藻则呈相反的分布特征。海区平均生物量很低，但玉米黄素在四个季节的航次中最高。因此，浮游植物光合色素在黄海冷水团的影响下表现出不同的分布模式。10月，从近岸到外海生物量逐渐降低，黄海冷水团衰退，但对浮游植物群群落结构的影响在中心区依然明显，定鞭金藻和蓝藻在南部海区仍有一定的分布。3月黄海冷水团消失，水层垂直混合均匀，浮游植物没有明显的垂直分布差异。本文重点分析了黄海冷水团区域水团温盐结构和营养盐供应对浮游植物光合色素浓度及浮游植物类群结构季节变动的影响，探讨了浮游植物类群结构对冷水团的响应。