小RNA高通量测序及组装技术是鉴定植物DNA和RNA病毒的有效方法。田间采集表现不同症状的烟草病毒病样本,经RNA提取,小RNA分离,构建小RNA文库进行高通量测序以期探明样本病毒组。小RNA经Velvet和Oases组装成重叠群,Oases组装的重叠群平均长度290nt,其组装结果是Velvet组装重叠群长度的4.3倍。因此,通过Oases组装的重叠群可以更好的获得病毒基因组序列并发现新病毒。组装的重叠群与Gen Bank已经报道的序列进行核酸和蛋白比对,采集样本中发现12种已知病毒和一种新病毒。其中一种病毒与已经报道的Mint virus 1同源性达65%,初步命名为Mint like virus安徽分离物(MLV-AH)。MLV-AH基因组全长15396nt,包含9个开放阅读框。同源性热激蛋白70 Hsp70h序列聚类分析表明,MLV-AH属于线性病毒属Closterovirus新成员。该研究首次报道了线性病毒属成员可以侵染烟草。