灭绝级植物爪耳木濒危机制与生物信息学挖掘鉴定爪耳木中GA相关基因研究

来源 :海南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:twesai
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
爪耳木Lepisanthes unilocularis Lennhouts[Otophora unilocularis(Leenh.)H.S.Lo]隶属无患子科(Sapindaceae)鳞花木属(Lepisanthes)常绿灌木,为国家Ⅲ级重点保护野生植物,为海南特有灭绝(EX)级植物。爪耳木历经80年再次被发现,它的濒危机制及其分子机理尚不明确。为研究并尝试解决爪耳木的濒危机制,现有的研究结果表明:爪耳木面临的最大难题在于有性生殖困难。雄花极少且雌、雄花期不遇;种子易脱水失活,自然发芽率很低种种因素导致了爪耳木目前濒危的处境。为研究爪耳木的濒危机制,本文通过实验得到了以下结果:(1)本实验通过测定叶功能性状来探究爪耳木自身生长发育的需求以及其与环境因子间的关系。测定爪耳木新叶(NL),老叶(OL)的鲜重(WF)、饱水重(WT)、干重(WD)、叶面积(LA)、叶含水量(LWC)、相对含水量(LRWC)、比叶重(SLW)、叶全氮含量(LNC)、叶全磷含量(LPC)。对这些性状进行差异显著性分析、相关性分析、因子分析和主成分分析得到:NL的LWC(60.21%)极显著大于OL(52.17%);NL的WD(0.037g)和SLW(0.013g)均显著小于OL(0.046g和0.017g)。WD、LWC、SLW和LPC等4个性状对爪耳木叶生长发育有重要影响。(2)本实验运用k-mer法预估爪耳木的基因组大小,使用jelyfish处理141G爪耳木测序数据,以k=21的片段长度计数,根据其分布来统计得到爪耳木基因组大小约为880.13Mb,非重复序列47.5%,杂合度约为0.388%。流式细胞术结果表明爪耳木为二倍体植物,其基因组大小约为921.11Mb。(3)本实验测定了爪耳木在正常生长期、开花期、开花末期三个阶段的内源GA、ABA、IAA含量,发现根中的内源GA含量在花期大大提升(0.063μg/g;0.253μg/g;0.736μg/g);在叶中显著下降(3.141μg/g;0.252μg/g;0.154μg/g);茎中无明显变化(0.430μg/g;0.317μg/g;0.367μg/g)。内源ABA含量在根部(0.120μg/g;0.498μg/g;0.944μg/g)和茎中(0.347μg/g;0.607μg/g;1.156μg/g)明显上升;叶中明显下降(2.524μg/g;1.539μg/g;1.365μg/g)。内源IAA含量在根(0.126μg/g;0.134μg/g;0.060μg/g)和叶(0.618μg/g;0.081μg/g;0.101μg/g)中降低;在茎(0.208μg/g;0.421μg/g;0.042μg/g)中经历了先上升后降低的过程。GA途径作为六大成花途径之一,内源GA是影响爪耳木成花的一个重要因素,研究者选择从GA合成关键酶基因的挖掘鉴定入手,尝试了解爪耳木濒危机制的分子机理。(4)本实验根据已知且功能得到验证的拟南芥赤霉素合成关键酶(GA2ox,GA3ox和GA20ox)基因家族在爪耳木基因组数据中挖掘鉴定。蛋白结构域鉴定结果显示:GA2ox,GA3ox和GA20ox拥有相同的两个结构域DIOX_N和2OG-Fell_Oxy。鉴定得到6条可能的爪耳木GA2ox同源基因;4条可能的爪耳木GA3ox同源基因;5条可能的爪耳木GA20ox同源基因。这些基因在爪耳木不同部位特别是花中的差异表达可能是影响爪耳木成花的一个关键因素。本研究通过测定叶功能性状、鉴定基因组倍性及大小、检测内源GA、挖掘GA合成酶相关基因的方法,总结出爪耳木灭绝的原因可能是成花相关的基因在爪耳木遗传繁育的过程中发生了抑制、沉默或是错漏,因爪耳木本身种群极小,基因频率低,导致无法恢复过来,最后走向灭绝。本研究为找到该突变基因和解决爪耳木濒危机制提供了思路和分子基础。
其他文献
目的:抑制炎症性骨溶解已成为假体周围骨溶解(periprosthetic osteolysis,PPO)药物治疗的主要靶点。MiR-106b是新发现的miRNA,在肿瘤生物学、炎症、骨量调控等方面发挥重要作
中国小麦花叶病毒(Chinese wheat mosaic virus,CWMV)是土传小麦花叶病害的重要病原之一,其基因组含2条单链正义RNA(RNA1-2)。近年本实验室在大量前期工作的基础上成功构建了CWMV
圆柱壳作为结构的基本构件被广泛应用于各类工程和民用领域中,如:各种飞行器、医疗器械、兵器、船舶等均采用壳体。其屈曲的研究一直都受到广大学者的关注,目前静力屈曲问题的研究已较为充分,但动力屈曲的研究仍充满挑战。本文研究了刚性质量块轴向撞击圆柱壳的屈曲行为,研究内容为:1.简述圆柱壳屈曲问题的研究现状。2.基于能量法,考虑应力波效应,建立拉格朗日函数,将其和计算获得的符合边界条件的准试函数代入第二类拉
目的:观察电针心经心包经穴对MCAO/R大鼠脑组织中Me CP2磷酸化修饰途径mi R137/EZH2表达的影响,验证电针心经心包经穴能抗脑缺血损伤,且p Me CP2/mi R137/EZH2在该过程中起促
波形钢腹板部分斜拉桥作为一种相对新颖的桥梁结构类型,在其建设数量逐渐增加的同时衍生出两大需求:(1)力学性能的进一步明确;(2)运营阶段性能评估方法的建立。但通过对国内
在全球化的背景下,企业发展速度加快,组织内部人员结构也随之变革,90后员工已经大规模进入职场,由于90后员工具备不同于70、80后的时代特点,若企业缺乏对新一代员工与时俱进
鲁梅克斯(Rumex)是蓼科酸模属多年生宿根草本植物,它作为新型的高蛋白饲科和优良的防止水土流失、改善生态环境的地被植物引种于俄罗斯。近年来,我国对鲁梅克斯的营养成分、
面对国内原油供需缺口越来越大的问题,水力压裂成为提高油气采收率的关键手段,对压裂后井下裂缝发育情况的监测是判断水力压裂效果的重要依据。为了获取更准确的裂缝信息,解决微地震监测技术对裂缝监测存在较大误差的问题,利用井下含流体孔隙地层受震源激发产生震电效应的机制,本文提出了微地震与震电联合监测方法,并设计完成了联合数据采集系统。本文研究的重点是单站双通道的联合数据采集仪,适合大规模、多道数的地震和裂缝
作为中亚造山带的重要组成部分,东准噶尔构造带与西准噶尔构造带均经历了多期次、多阶段、漫长而复杂的构造演化过程,形成了丰富多样的地质记录。两个地区许多地质记录既有“
现今消费市场竞争日益激烈,国外品牌的商品不断涌入中国的消费市场,如果我们没有自己的品牌没有自主创新设计出新的品牌视觉形象就很难在市场中占有一席之地,商品的品牌形象是最直接吸引消费者眼球的,在地方特产中却不易发现优秀的品牌形象设计,因此树立品牌意识、完善包装设计就显得尤为重要。新郑红枣作为新郑地区经济发展的支柱产业,有着悠久的种植历史,红枣以其味甜、肉厚、核小的特点深受人们的喜爱,在河南地区非常有名