我们正处于一个快速进步的时代,同行间的角逐逐渐白热化,这样的大环境为企业的生存与发展提出了更加严苛的要求,而为了适应当前的市场,创新便成了企业能够长久生存下去的前提条件。只有不断创新,企业才能在这竞争日益激烈的市场中生存下来。高科技行业是当前进行创新的一大重要载体,而医药制造业又是高科技行业的典型代表之一,也是社会关注的一大焦点。21世纪后,医药制造业的动态受到了全世界的关心,特别是近几年,人口的老龄化现象越来越严重、公众对于自身的保养越来越重视,这就导致大众对于医药制造业的要求越来越多。所以,怎样才能合理的提高医药制造业的创新水平、推动其绩效发展、维持其健康稳定,就变得尤为重要。本次研究首先分析创新能力的内涵及其构成要素,然后分析当前我国医药制造业上市公司创新能力与绩效的现状,最后挑选出医药制造业的51家公司作为研究对象,对医药制造业的创新能力同绩效的影响联系做了更深层次的探究。在分析探究中,从技术层面的创新、管理层面的创新和营销层面的创新这三个维度选取了8个创新能力的指标作为自变量,从医药制造业上市公司2015-2019年五年的财务绩效指标中选取了12个财务指标用因子分析法综合成一个综合绩效指标作为因变量,将企业的规模大小和企业的性质作为控制变量,采用实证的方法把创新能力同绩效的联系进行了探究。分析得出,无形资产的占比同绩效间是存在负向的联系的,而其他创新能力指标对绩效均起到正向推动作用。最后,根据理论及实证研究,为企业管理层合理配置资源提出建议并为其健康稳定发展提供理论帮助。