我国改革开放以来,社会主义市场经济建设的步伐不断加快,特别是在加入WTO以后各领域市场竞争日趋激烈,南通市特色产业的发展在面临机遇期的同时更面临着危机与挑战。南通市政府如何顺应世界形势,把握时代脉搏,制定出适合本地区特色产业发展的集群政策,促进本地区特色产业的长期发展,已经成为南通地方政府治理过程中亟待解决的重要问题。南通市政府制定产业政策的立足点在于本地区经济发展水平、人口素质、基础设施建设情况及地理区位等自然环境资源。制定产业政策的目的在于促进本地区经济的快速、健康发展和政府财政收入的快速增长。南通市政府在本地区经济发展中既是既得利益主体、又是管理主体；因此,政府在追求政绩的同时,大搞新项目开发,扩大企业规模、增强本地区的经济总量；扩张势必带来一定的问题。特色产业的健康发展离不开产业集群的规模化优势经营,南通市政府要想发展特色产业,必须走集群化发展的道路,因此制定特色产业的集群政策是发展特色产业的必由之路。本文对特色产业、产业集群、产业政策以及产业政策对特色产业的作用等方面进行了详细的分析,并且以南通市政府制定船舶产业政策为例进行实证分析。总结出特色产业集群政策的制定,首先要能够弥补“市场失灵”的缺陷；其次、要将“政府失灵”的影响降到最低；第三、要建立科学完备的评价体系；第四、创新管理体系,优化产业结构；第五、合理规划、科学布局,完善特色产业集群周边的基础设施建设；第六、建立公平、正义、适合中小企业发展的产业环境。只有符合上述六大要素,建立的产业集群政策才是科学、完备的产业政策,才能促进南通特色产业的长期可持续发展。