云南腾冲及西藏曲才地热区可培养高温厌氧细菌多样性研究

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云南和西藏是我国重要的地热分布区,这里孕育着丰富的高温微生物资源,对其进行研究不仅有助于高温菌资源的开发和利用,还可以获得有关其演化的重要信息。目前用免培养和纯培养方法对高温好氧细菌有了较为深入的研究,而对高温厌氧细菌的研究则处于起步阶段。本论文通过对热泉样品厌氧细菌分离和培养技术的摸索与优化,形成了分离和培养高温厌氧细菌可靠的技术路线,并利用此种纯培养技术对云南腾冲热海、瑞滇及西藏曲才共18个高温热泉进行了高温厌氧细菌多样性的研究。从以上18个热泉中共分离出51株细菌,利用16S rRNA基因序列系统发育分析对所有菌进行了初步鉴定,确定了其分类地位。结果表明,这51株细菌分别属于厌氧芽孢杆菌属(Anoxybacillus9株)、芽孢杆菌属(Bacillus15株)、一氧化碳胞菌属(Carboxydocella1株)、梭状芽孢杆菌属(Clostridium4株)、杂乱杆菌属(Effusibacillus2株)、肠球菌属’Enterococcus1株)、加西氏菌属(Garciella1株)、栖温境单胞菌属(Tepidimonas1株)、好热厌氧小杆菌属(Thermoanaerobacterium5株)、高温放线菌属(Thermoactinomyces1株)、热单胞菌属(Thermomonas1株)、热分支菌属(Thermobrachium3株)和喜热菌属(Caloramator7株),其中厌氧芽孢杆菌属(Anoxybacillus)禾口芽孢杆菌属Bacillus)的菌株居多。这些菌株大多为已知的高温厌氧菌,有7株菌与已知的高温厌氧菌16S rRNA基因序列同源性最高介于93.26-98.45%,系统发育分析表明这些菌株为潜在的新分类单元。选择2个候选新分类单元菌株进行了包括形态特征与培养特征观察,生理生化测定、细胞化学组分分析和16S rRNA基因序列系统发育分析等在内的多相分类研究,确定了2个菌株的分类地位,菌株YIMG1-1T为加西亚氏属(Garci lla)的一个新种,被命名为Garcilla tengchongensis sp. nov.,菌株YIM A1-8T为Clostridium的一个新种,被命名为Clostridium tengchongensis sp. nov.本次研究获得了一批高温厌氧细菌菌株,丰富了我国的高温厌氧菌资源,为进一步探索其多样性特征、地理分布规律及应用奠定了基础。
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