杞柳和簸箕柳SSR指纹图谱及遗传多样性分析

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本文采用微卫星(SSR)分子标记技术,研究了杞柳(Salix intagra)和簸箕柳(S.suchowensis Cheng)的遗传多样性和指纹图谱,并在此基础上对柳树进一步研究工作进行了探讨。主要结果如下: 从496对杨树引物筛选出23对多态引物,对78个杞柳个体和19个簸箕柳个体进行了分析。SSR引物扩增出的等位基因数(Ne)平均为4.3913,有效等位基因数(Ne)平均为2.2199,平均期望杂合度(He)为0.4350,Nei多样性指数(h)为0.4409,Shannon多样性指数平均为0.8600,表明柳树种内和种间遗传多样性较高。 杞柳种内扩增出23个SSR多态位点,等位基因的平均数A=3.8261,平均有效等位基因数Ne=2.1097。Shannon多样性指数值平均为0.7678。簸箕柳种内共扩增出19个SSR多态位点,等位基因的平均数A=2.5217,平均有效等位基因数Ne=1.6345,Shannon多样性指数平均为0.5541。研究结果表明:杞柳种内遗传多样度比簸箕柳高,遗传变异比簸箕柳明显。 本研究所筛选出的23对SSR引物中,引物ORNL146可以将杞柳和簸箕柳区分开来。杞柳11~127具有特异的等位基因序列,引物ORNL308可以将其与其他51个杞柳个体区分开来,并将78个杞柳个体明显分为两部分,第一部分杞柳I1~I27共27个不同的个体,引物ORNL312、ORNL301、ORNL217、ORNL282、ORNL140、ORNL211、ORNL410、ORNL149、ORNL63共9对引物为鉴别这27个个体的核心引物;第二部分杞柳共51个个体,引物ORNL312、ORNL308、ORNL217、ORNL301、ORNL146共5对引物是鉴别这51个个体的核心引物。引物ORNL464、ORNL140、ORNL409、ORNL126、ORNL122、ORNL85、ORNL149共7对引物是区分19个簸箕柳个体的核心引物。引物ORNL312扩增出的等位基因序列最多,有11个,辨别不同个体能力最高,在其扩增的指纹中,有18个杞柳个体具有特异的谱带。引物ORNL464在簸箕柳种内辨别能力最高,有4个簸箕柳个体具有特异性谱带。引物ORNL146、ORNL464、ORNL312、ORNL308在指纹图谱中有较高的辨别能力。共筛选出15对核心引物可鉴定全部供试材料,即可将97个个体区分开来。 针对柳树物种的生物学及遗传学特性,认为柳树具有很高的林木遗传学研究价值。本论文对杞柳和簸箕柳进行了初步研究,为其进一步研究打下基础。
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