青花菜软腐病病程的cDNA-AFLP差异表达分析

来源 :福建农林大学 | 被引量 : 6次 | 上传用户:mayf014
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青花菜(Brassica oleracea L. Var. Italica)属十字花科(Cruciferae)、芸薹属(Brassica)、甘蓝种(Brassica species)。青花菜食用部分是其分化花蕾组成的花球及鲜嫩的花茎,不仅风味鲜美,营养也特别丰富,除含有较高的蛋白质及维生素外,还含有β胡萝卜素、吲哚等有利于人体健康的微量元素和抗癌物质。软腐病常发生在青花菜的生长、运输、贮藏等过程,是十字花科蔬菜的主要病害之一,其致病菌为欧文氏胡萝卜亚种。本试验用软腐病病原菌接种青花菜叶片,在接种后0-7h,每小时取一次样,测定其生理指标。取第0h、1h、4h、7h的材料应用cDNA-AFLP技术研究分析青花菜感病过程中差异表达基因,并利用RACE克隆技术克隆获得LRR、WRKY两条基因的cDNA。1、开展了软腐病病程相关的活性氧代谢研究。结果表明,随着感病时间的推移,细胞膜透性、MDA含量呈现上升趋势,SOD、POD呈现先降低后升高再降低的趋势, CAT酶活性变化不大,说明活性氧代谢在青花菜对软腐病病源菌的响应中起到一定的作用。SOD、POD在低浓度时增强青花菜对病原菌的抗性,高浓度时降低青花菜对病原菌的抗性。2、建立了青花菜cDNA-AFLP反应体系,20μL体系各个组分最佳用量为:模板用量为40ng、引物用量为0.4μmol·μL-1、dNTP用量为0.2mmol·L-1、Ex-Taq酶用量为0.5U。3、开展了青花菜感病过程中差异表达基因cDNA-AFLP。应用了128对引物,最终获得了102条TDFs,测序成功91个,将这些序列在VecScreen中去载体,在NCBI里进行Blast,比对结果显示:同源性较低的序列5个,来源物种为细菌的序列5个,来源为动物序列的1个,最后得到80个同源性较高的差异片段基因。根据功能的不同,初步将其分为8类:信号转导相关基因、抗病相关基因、生物合成关键酶基因、蛋白质合成与修饰相关基因、逆境响应相关基因、代谢途径相关酶类基因、转录因子以及一些其它未知功能的基因。4、克隆了LRR、WRKY的cDNA。其中LRR基因cDNA全长1235bp,开放阅读框共有903个碱基组成,编码301个氨基酸,在GenBank上登录号为:KC476519,该基因属于R基因,通过对其蛋白结构的预测推测其具为TM结构域、胞外LRR结构域和丝/苏氨酸激酶位点。WRKY基因cDNA全长为1710bp,开放阅读框共有1500个碱基组成,编码500个氨基酸,在GenBank上登录号为:KC476520,该基因属于转录因子,具有WRKY基因的特征序列WRKYGOK。
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