信使RNA(mRNA)携带着DNA的遗传信息并传递遗传信息到细胞中的不同区域。研究发现大量的mRNA在细胞中并非随机分布而是聚集在特定的亚细胞区域。mRNA的亚细胞定位造成的mRNA和蛋白质在细胞内不均衡分布对细胞极性的形成、细胞运动的发生和细胞生长发育发挥重要作用。因此,研究mRNA亚细胞定位对理解mRNA的功能以及细胞的时空调控机制至关重要。RNA原位荧光杂交技术和高通量的RNA亚细胞测序技术被广泛应用于检测mRNA亚细胞水平的空间分布情况。随着生物实验技术不断优化,目前原位杂交技术和测序技术可实现多种细胞环境下高分辨率RNA亚细胞图谱的绘制,为研究mRNA亚细胞定位机制和揭示基因表达调控机制提供了可靠的信息资源。然而,生物实验技术操作繁琐且费用昂贵,因此迫切需要采用计算生物学方法开发mRNA亚细胞定位预测模型实现mRNA亚细胞定位信息的快速获取。本研究从RNALocate中获取人类mRNA的亚细胞定位数据,从Gen Bank中获取对应mRNA的序列。假设数据中单标签的mRNA能提供更多的亚细胞定位信息,本研究仅保留了单标签mRNA亚细胞定位数据构建基准数据集。研究采用核苷酸九联体表征原始mRNA序列,使用二项分布特征选择方法和方差分析特征选择方法筛选最优特征子集降低特征维度。经过两轮特征选择,得到包含29745个核苷酸九联体的最优特征子集。基于最优特征子集,使用支持向量机算法构建人类mRNA亚细胞定位预测模型。五折交叉验证结果显示该模型的总体分类精度达到90.12%,可以准确地判断mRNA亚细胞定位靶标区域,意味着该预测模型可以为mRNA亚细胞定位机制提供参考。为方便科研工作者使用该模型进行mRNA亚细胞定位区域的预测,我们建立了便捷免费的网站服务http://lin-group.cn/server/iLoc-mRNA/。