《内经》“脏气法时”思想主要探讨人体的生命节律。受时间生物学兴起的影响,“脏气法时”思想越来越受到重视。当前对“脏气法时”思想的研究,文献方面还停留在对《内经》人体节律的整理阶段,尚未探讨深层次的产生原因、内部逻辑等问题,所以还有很多工作要做。实验方面,普遍存在着忽视“脏气法时”对应性特征的问题,其原因是研究者对中医五脏实质的认识不足。本文讨论的“脏气法时”话题范围是广义的,凡《内经》里与时间节律有关的主题,都被列入讨论范围。其中五脏、六腑、十二经脉属于“脏气法时”的生理方面内容,九宫八风和五运六气属于“脏气法时”的病因方面内容。“脏气法时”思想产生的原因,是古人从“天圆地方”观念出发,用原始思维方式,形成了以数术为表现,以法时为特色的知识体系。“脏气法时”思想由此派生。“天圆地方”观念是阴阳五行思想产生的基础。“天圆地方”可分为三种模式:“亞”型模式,九宫模式和六壬模式。在“亞”型模式中,探讨了五脏本质问题。认为是五行决定了五脏的由来,中医认识五脏的道路是科学与文化交织、观察与想象融合。具体的医疗实践使五脏五行配属由解剖模型向功能模型转变。古人把人体内的气机变化归纳为生长化收藏几种趋势,而五脏被认为是这几种趋势的基础。在对“四时五脏阴阳”结构的讨论中,认为“五时”不是常用词,不赞成“五脏应五时”的说法。在对“五脏休王”的讨论中,认为五行相生符合“天圆地方”时空观念,其实质是流动时间的空间化表达和具体空间的时序化表达。而五行相克来源于五材的具体特性,与四时五方之理不同,故有关五脏相克的内容无研究必要。对中医用五行生克解释五脏关系、解释临床治疗,认为此处五行生克经过理论修饰,概念转换,已非本来面目。对五脏实质现代研究的反思,认为最可行的办法是把实体模型和功能模型分割开来。属于实体模型的部分,可以寻找对应的物质基础。但这条路本身有局限性,研究越向微观发展,越不适合解释实体模型。属于功能模型的部分,要把注意力放在人体升降浮沉的气机变化上,不要受实体模型的影响。两种模型的区别主要是动态和静态的区别。功能模型没有特异性物质基础,导师烟建华教授曾提出“非特异性物质时空分布说”,认为其实质是体内微观物质在数量、比例或分布趋势上的变化。在九宫模式中,探讨了九脏和九宫八风问题。九脏中仍是五脏处于主导地位,但依据的是解剖模型。九脏与“三部九候”相关,“三部九候”的概念演变一直保留着解剖模型的特征。关于九宫八风,认为与风角候气有关。《内经》的“虚风”概念源于八节候八风,提出了“虚风以时至”的观点。并论证虚风是多种疾病,尤其是瘟疫的病因,《内经》对瘟疫发病的解释,就是虚风伏邪发病。在六壬模式中,讨论了“天六地五”与六腑的数目问题。对十二经脉问题,认为十二月决定了十二经脉。虽然早期经脉系统没有手厥阴经,但它以足臂分类,以双足十二脉对应十二月。后来经脉系统发展到十二经脉,构成完整的经脉循环,才以阴阳内外分类。经络理论不全是客观描述,也有很多观念因素,研究经络实质应该注意到这一点。对五运六气问题的讨论,否认“五运六气历”的存在,认为运气学说的小运主气符合自然节律,但大运客气只是节律观念的无限推衍,反对当前耗费人力物力去证明其合理性。总之,《内经》认识人体多依据时间节律,偏重理解人体的时间结构,偏重研究人体的功能模式。