本文运用植物形态学、解剖学、细胞生物学、生物化学技术，对北柴胡、南柴胡和三岛柴胡进行了比较研究。结果如下： 1．北柴胡主根粗短，无刷状残余纤维；南柴胡主根质疏松而脆，有残余纤维，呈毛刷状；三岛柴胡根基枯纤维少。北柴胡茎从生或单生，茎基部无纤维状叶柄，残基物为紫红色；南柴胡茎单一或2～3丛生，茎基部有棕色或红色纤维状叶柄，残基物为绿色；三岛柴胡茎单一或数多，基部为紫黄色。北柴胡基生叶柄均为紫红色，茎生叶为长圆状披针形；南柴胡茎生叶及茎下部叶有长柄，条形或狭条形，为绿色；三岛柴胡茎生叶及下部叶有叶柄，为紫红色，叶片呈黄绿色。 2．北柴胡、南柴胡和三岛柴胡根的初生结构和次生结构基本相同。 3．茎中有限外韧型维管束和油室数目不同，每种柴胡的维管束与油室数目相等，北柴胡为16个，南胡多为28～31个，少为16个。 4．叶的主要区别在于栅栏组织和厚角组织两方面，北柴胡在上表皮之下有栅栏组织，而南柴胡在上、下表皮以内均为栅栏组织。北柴胡主脉维管束的下方与下表皮之间有厚角组织，上方与上表皮之间为薄壁细胞，使北柴胡叶脉仅在叶背面具有显著突起。而南柴胡在主脉维管束上、下方均有厚角组织，上方厚角组织较下方少，而南柴胡的叶脉在叶片的背腹两面均有突起，只是背面突起较腹面大。 5．北柴胡染色体数为2n=24，核型公式K2n=14m(2st)+10sm：南柴胡染色体数为2n=12，核型公式K2n=12=10m(2SAT)+2Sm；三岛柴胡染色体数为2n=26，核型公式K2n=26=16m+10Sm(2SAT)。 6．三种柴胡在化学成分上差异较大。 7．三种柴胡12个居群做了种子游离氨基酸成分分析，发现南柴胡9个居群中种子游离氨基酸种内存在变异，而三种柴胡游离氨基酸种类变异较大，可以作为三种柴胡分类的指标。