玉米杂种优势群划分高分辨率SSR引物体系建立

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玉米杂种优势类群划分是现代玉米品种改良最重要的概念和技术之一。玉米自交系改良常在相近类群间杂交,这种杂交不仅产生不同父母本染色体数目组成的新类型,也因交换等因素常发生染色体特殊位点改变。这些改变,尤其是SSR位点改变,意味着已经建立的SSR引物体系中的该位点专一性下降。因此,不断筛选新的高多态性标记位点,建立新的SSR引物体系,对新培育的玉米自交系类群划分有重要意义,是玉米分子育种常规性工作。为了建立新的SSR引物体系,用目前常用的核心SSR引物,以及从玉米SSR库中遴选均匀分布在10条染色体上的SSR,共160对引物,检测42个已知玉米杂种优势群的遗传多样性,然后根据各自交系的PIC,筛选高分辨率SSR,并在这些SSR中遴选不同的SSR数量组合,建立分辨率高、分类准确,以及检测工作量小的引物体系。建立的引物体系然后在104个已知和未知类群的自交系中验证检测,结果遴选了一个新的40对引物和20对引物组成的新引物体系组合。该引物体系组合能够正确划分国内常见的玉米杂种优势类群,也能够分辨重组遗传结构的自交系,认为可作为一组新的SSR引物组合,用于玉米自交系杂种优势类群划分。主要结果如下:1.160对引物对已知类群的42份材料进行PCR扩增,结果发现其中63对引物的扩增结果带型稳定,多态性高。PowerMarkerV3.25计算该63对引物PIC值,最高0.7623,最低0.1545。根据引物的染色体分布,以及每个染色体上引物的PIC值,根据常用引物体系的引物数量,分别取40对、30对、20对和10对共4个引物体系,对42个材料模拟分类。结果显示,40和30对引物体系的分类结果均与已知类群高度吻合,20对引物体系的分类结果与40对引物体系结果基本一致,10对引物体系的分类结果与40对引物体系结果差异较大。40对引物体系在42份材料中共检测到等位基因变异169个,每对引物检测的等位基因数为3~7个,平均4.225个,基因多样性范围在0.498~0.800之间,平均0.693,多态性信息量范围在0.427~0.770之间,平均0.631。20对引物体系在42份材料中共检测到等位基因变异101个,每对引物检测的等位基因数为4~7个,平均5.05个,基因多样性范围在0.638~0.803之间,平均0.729,多态性信息量范围在0.578~0.774。这些参数表明新的40对引物体系和低检测工作量的20对引物体系是一组多态性高,分类效果良好的新核心引物体系。2.为了进一步验证该新引物体系的性能和分辨率,将40对引物体系和20对引物体系对104个玉米自交系材料进行分类验证。结果发现,类群数(K值)设1~15,K=4时△K值最大,104份自交系分类为4大种质类群,即瑞德、改良瑞德、兰卡斯特和黄改,这与目前我国利用的优势类群结果一致;当K=7时,即可分辨出旅大红骨,以及与四大类群各自相近的未知群,这些未知群是该群的改良系或混合种质。相同的方法,20引物体系的分类结果与40对引物体系分类结果比较,代表性材料分类结果完全一致,少量混合种质材料分类在不同亚类中,但仍属相同杂种优势类群。这些结果建议指出,40对引物体系对玉米自交系类群划分有高的分辨率,可识别已知类群、未知类群、中间型等各种种质资源,可应用于玉米自交系杂种优势类群的精确划分;20对引物体系检测工作量小,分类结果与40对引物体系的结果基本一致,可应用于大批量材料的初级类群划分。
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