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参考Lee等报道的NP基因的引物，建立A型流感病毒的RT-PCR检测方法，检测2004年10月到2005年3月从江苏省的洪泽湖、高邮湖、盐城湿地自然保护区内13种野鸭采集的256份泄殖腔拭子，检测结果显示，52.34％(134／256)的野鸭带有A型流感病毒，其中绿头鸭、花脸鸭、白秋沙鸭、翘鼻麻鸭大于等于80％，表明在江苏省越冬的野鸭流感病毒带毒率非常高。通过SPF鸡胚尿囊腔接种法进行病毒分离，分离到23株病毒，经国家禽流感参考实验室鉴定为A型禽流感病毒。鸡胚分离率为8.98％(23／256)。 将绿翅鸭分离株A／Common Teal／XuYi／04和斑嘴鸭分离株spdkYC1905、spdkXy2305、spdkXy2505四株分离株的NP基因330bp片断RT-PCR扩增克隆测序，序列在GenBank上Blast，结果显示，A／Common Teal／XuYi／04与人源及猪源的H3N2同源性为95％；spdkYC1905与1997年香港H5N1同源性为96％；spdkXy2305与2004年东南亚暴发的H5N1型HPAIV同源性高达99％；spdkXy2505与2000年以来我国香港、广西等地各种来源的H5N1同源性为96％。说明江苏湿地野鸭中存在的流感病毒具有重要的公共卫生意义，同时对畜牧业造成潜在威胁。 对禽流感病毒绿头鸭盱眙分离株maXY804的HA、PB2、NP、M、NS基因进行克隆测序，序列在GenBank上Blast，结果显示，在GenBank数据库中没有与maXY804的HA、PB2、NP、M、NS基因完全匹配的序列。上述蛋白基因与不同地区的流感病毒分离株有不同的亲缘关系。NP、NS基因与欧洲的流感病毒同源性高，M、PB2与我国沿海地区分离的流感病毒同源性高。 对10株本实验分离的流感病毒分离株的M基因进行分析，结果表明，这10株分离株的M基因可以分为两簇：第一簇包括7株：绿头鸭分离株maGY3305、maXY804；斑嘴鸭分离株spdkYC1905、spdkXy2505；花脸鸭分离株btHZ1605、btXY1805及普通秋沙鸭分离株gsdHZ705；第二簇包括3株：花脸鸭分离株btXY1705、斑嘴鸭分离株spdkXy2305和绿头鸭分离株maGY3105。第一簇与意大利火鸡中的低致病力的tkIt02(H7N3)在同一进化分枝上，同源性为97.6％。第二簇btXY1705、spdkXy2305、maGY3105与从鄱阳湖健康野鸭中分离的禽流感病毒midkJx05(H5N1)同源高达99.3％～99.8％；与引起青海湖斑头雁暴发HPAIV