内吗啡肽是一种对疼痛有着非常强的抑制作用的内源性多肽。即使在很低的剂量下,这种神经肽依然可以有效的抑制神经性的疼痛,相对于其他阿片肽物质它更能有效的发挥作用,所以利用内吗啡肽作用先导多肽进行药物开发是非常有意义的。为了探明内吗啡肽及其类似物同受体之间的相互作用,我们将一系列的内吗啡肽类似物对接到了mu阿片肽受体当中。对接后我们采用细胞膜-水的环境对配体-受体复合物进行了结构上的优化。通过分析这些类似物的结合方式,我们发现了一些较为显著的结合差异,同时一些在配体的识别与结合中起到重要作用的氨基酸也被发现,我们的配体-受体相互作用模型和受体的定点突变试验有着非常好的一致性。现在有越来越多的实验表明,很多G蛋白偶联受体在机体的细胞上可以以同源二聚体或是异源二聚体的形式存在。其中,mu阿片受体和delta阿片受体的异源二聚化现象引起了科学家的广泛关注,因为这种异源二聚体复合物会产生新的构效关系,并且影响细胞信号的传导方式。在我们的试验中,我们通过同源模拟的方法,构建了mu阿片肽受体和delta阿片肽受体包含全部氨基酸的全长三维受体。同时利用线程类算法来预测受体N末端和C末端可能的模板。之后,我们对同源模型进行了30ns的分子动力学优化,模拟环境为细胞膜-水。利用从分子动力学轨迹当中提取出来的有效结构,我们采用蛋白质-蛋白质对接,结构分簇,接触面分析以及相互作用能量分析的手段来探索mu阿片肽受体和delta阿片肽受体之间可能的作用方式。我们的计算结果显示,该异源二聚体的接触面最优可能形成于mu阿片肽受体的跨膜螺旋1和7,以及delta阿片肽受体的跨膜螺旋4和5之间,其中mu受体的跨膜螺旋1和delta受体跨膜螺旋4之间的相互作用显得更为显著。而另一种有可能的结合方式是,mu阿片肽受体的跨膜螺旋6和7与delta阿片肽受体的跨膜螺旋4和5之间形成接触面,在这种模型中,mu受体的跨膜螺旋1与delta受体的跨膜螺旋4之间有更紧密的相互作用。我们的实验结果同之前生物化学和计算机模拟实验的结果相吻合。