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多重耐药基因cfr是目前发现的第一种可同时介导恶唑烷酮类、截短侧耳素类、链阳菌素A、林可胺类和酰胺醇类五类抗菌药物耐药的甲基转移酶。可编码23S rRNA甲基化酶,进而导致上述药物耐药。更值得注意的是,cfr基因是迄今为止发现的第一种介导恶唑烷酮类和截短侧耳素类药物耐药水平传播的耐药机制。当前,cfr基因在动物源菌株中的耐药流行状况被大量报道,但关于cfr基因在环境源菌株中的流行特征报道相对较少。其在环境来源大肠杆菌中的流行状况及传播特点有待进一步探究。因此,本研究对全国不同地区的养殖场动物及其周围环境中携带cfr的大肠杆菌的流行特征和传播机制进行探究,以期帮助我们更多地了解cfr基因在大肠杆菌中的流行情况及流行原因,为临床治疗耐药菌株感染提供思路。2017年,在全国16个省份的的养殖场内动物及周围环境中采集的6152份样本中分离、筛选、鉴定得到11196株大肠杆菌,采用PCR检测发现共30株携带cfr基因的大肠杆菌,检出率为0.268%（30/11196）。其中22株菌从动物中分离,8株菌分离于养殖场周围环境。对这30株携带cfr基因的大肠杆菌开展了流性传播特征研究。采用琼脂二倍稀释法测定菌株对14种抗菌药物的敏感性。结果表明,这30株携带cfr的大肠杆菌对氟苯尼考、四环素全部耐药,对氯霉素、阿奇霉素、头孢噻肟、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑的耐药率均高于或等于90%,分别为96.67%、93.33%、90%、93.33%。环丙沙星、多粘菌素、庆大霉素、氨苄西林的耐药率介于70%至90%之间。这些菌株对替加环素全部敏感,美罗培南、阿米卡星、磷霉素的耐药率也相对较低。通过PCR扩增及测序检测16种常见的耐药基因。结果显示,blaTEM检出率最高,为60%,其次是oqxA,oqxB,qnrS,mphA,检出率分别为53.33%,50%,43.33%,43.33%。除此之外,只检出2株携带blaOXA、1株携带blaDHA、1株携带fosA3,而qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、rmtB、blaCTX-M、fosA、fosC2均没有检测到。采用PFGE对30株cfr阳性大肠杆菌株进行分子分型,分析菌株间的亲缘关系。结果显示,以90%的相似度为判定值,30株大肠杆菌存在17个不同的PFGE谱型,可见这30株cfr阳性大肠杆菌的遗传背景相对多样。值得注意的是,在同属于一个PFGE谱型的菌株中,发现两株分别分离自同一猪场的动物和环境的菌株,以及两株分离自同一猪场但不同阶段的猪只的菌株,谱型相似度高于95%。这表明在养殖场的动物与周围环境以及养殖场动物中存在cfr基因克隆传播的现象。通过接合转移实验与电转化实验,获得10株cfr接合子/电转子。药敏实验发现其对于氟苯尼考均耐药。除一株对氟苯尼考的MIC值为256μg/mL之外,其余9株对氟苯尼考的MIC值与原菌相比下降了4-8倍。采用S1-PFGE及Southern杂交对上述10株cfr接合子/电转子进行基因定位。结果显示,株大肠杆菌所携带的cfr基因定位于大小约为33kbp的可结合型质粒上。综上所述,养殖场动物与养殖场周围环境中携带cfr基因的大肠杆菌流行性较低,但这些菌株对兽医临床常使用的抗生素药物耐药现象严重,不但对抗生素表现出较高水平的耐药性,同时耐药基因分布广泛。携带cfr的大肠杆菌遗传背景多样化,但也存在克隆传播。在同一养殖场中,动物及其周围环境之间,可能存在cfr阳性大肠杆菌的克隆传播。水平传播和克隆传播共同造成了cfr基因在大肠杆菌中的流行。