随着以现代科学技术为核心，建立在知识和信息的生产、分配和使用上的新经济时代的到来，我国高校经费投入开始持续增加，办学规模不断扩大。但由于我国大部分高校教学基础设施薄弱，教育资金远远不能满足建设和发展的需求，教育经费使用效益不高的问题持续发酵，很大程度上制约了我国高校的教学质量。如何开展高校绩效审计，已经成为当前高校审计面临的重要难题。此外，目前我国高校审计仍以财务收支审计为主，对高校经常性经费的绩效审计还存在很多弊端，亟待开发适应新经济时代的高校绩效审计方法。基于此，当前关于高校绩效审计的系统研究还不多见，这也成为近阶段国内财务审计方面专家学者的重点研究方向。本文论述了高校开展绩效审计的现实意义，并且针对新经济时代我国高校绩效审计存在的突出问题，探索了解决方案。十八届三中全会上，《决定》围绕“深化教育领域综合改革”作了重要部署，对“努力办好人民满意的教育”具有丰富的指导意义。贯彻落实这一重要指示要求，适应新经济时代教育改革与发展的新形势，关键一环就是着力提升我国高校的绩效审计质量。本文从当前高等教育发展的现实出发，以绩效审计理论研究为基础，浅析新经济时代对我国高校传统审计产生的重要影响，论述了高校开展以提供增值服务为宗旨的绩效审计的必然性和可行性，探索了构建我国高校绩效审计的主体、方法和评价指标等内容，剖析了我国高校开展绩效审计存在的突出矛盾问题，最后提出了开展高校绩效审计的针对性措施办法。这对于实现十八大报告提出的关于“深化教育领域综合改革，着力提高教育质量”的重要指示，具有重要的理论指导意义和现实应用价值。