当前我国经济步入新常态,经济增长由要素驱动转变为创新驱动,更强调以创新促进整体产业的优化升级,推动我国经济更持续地健康发展。R&D作为科技创新活动的核心,其投入规模与产出水平早已成为衡量我国科技水平和创新能力的重要指标。自开展R&D调查统计工作以来,我国就不断加大R&D投入力度,R&D产出水平也年年创新高。可以说,不管是现阶段还是在未来,R&D将继续发挥其引擎作用,提升我国经济的新一轮高速增长。然而,由于我国幅员辽阔,人口众多,各地区在地理位置、产业结构、企业规模甚至经济水平等方面呈现出较大差异,导致我国R&D资源配置水平整体上呈现出非均衡态势,并伴随有多级分化现象。因此,准确洞悉我国R&D资源配置水平在时间和空间两个维度上分别呈现出何种演变趋势和分布状况,深入探讨造成我国总体差异较大的最主要的原因是什么,以及科学检测我国R&D资源配置水平是否存在非常明确的等级固化特征,对于进一步探索区域R&D活动的协调发展路径,进而促进我国区域经济均衡发展具有重要的理论价值和现实意义。本研究基于创新理论和区域发展理论,选用2002~2015年我国30个省市(自治区)的面板数据,从R&D投入、R&D产出和R&D影响三个方面构建了我国R&D资源配置水平指标评价体系,并借助熵权TOPSIS法、Dagum基尼系数、Markov链模型以及Kernel密度估计法分别计算了R&D水平的综合指数、考察了R&D水平的空间差异及其来源、描绘了R&D水平的动态演变特征。研究结果表明:我国以及东、中、西部地区R&D资源配置水平呈总体上升态势,而东北地区呈下降趋势;我国R&D资源配置水平的空间差异十分显著,其中东部地区内差异和东-西地区间差异尤为突出,地区间差异是造成总体差异的最主要原因;研究期内,我国R&D资源配置水平始终存在非常明显的等级固化特征,高水平地区一直处于高水平,而低水平地区一直维持在低水平,其中2010年前后这种等级固化特征更加恶化,更为明显的是,西部地区和东北地区的多级分化现象始终存在;区域R&D资源配置水平的相对差距和绝对差距存在截然不同的演变态势,前者呈减弱态势而后者却呈扩大态势。